Boom uitgevers Amsterdam heeft een bijzondere band met de vakgroep Economische en sociale geschiedenis en de vakgroep Internationale Betrekkingen van de Universiteit van Utrecht. Regelmatig worden bij Boom uitgevers Amsterdam boeken uitgegeven van onderzoekers die aan deze vakgroepen verbonden zijn. Bedrijfsgeschiedenissen, zoals Heineken 150 jaar en de BINT-reeks zijn in samenwerking met de Universiteit Utrecht verschenen.